關于如何保管遺體、怎樣妥善處置捐獻者遺體，《條例》缺失具體方法，因此，目前一些捐獻者遺體在使用后未能得到妥善處置。這讓很多捐贈遺體的家屬心寒，也讓很多有意愿捐贈遺體的人望而卻步。

很多遺體捐贈者未在生前就此事與其家人達成共識，導致相關工作人員在接受遺體時因為家屬的阻撓困難重重，甚至有工作人員無故被毆打的惡劣事件發(fā)生。對我國公益事業(yè)的發(fā)展有一定的影響。

很多遺體捐贈者不被家人所理解，認為“身體發(fā)膚受之父母”，死后也因遺體被捐贈不能帶回老家安葬。成為“孤魂野鬼”。

一些思想傳統(tǒng)落后的農村地區(qū)不明白情況，認為是親屬將捐贈者的器官賣掉，或者是捐贈者在外做了虧心事才“死無全尸”。正所謂人言可畏，給遺體捐贈者家屬也造成麻煩。