中統(tǒng)領(lǐng)導(dǎo)人是陳果夫、陳立夫兄弟，軍統(tǒng)領(lǐng)導(dǎo)人依次是戴笠、毛人鳳。中統(tǒng)和軍統(tǒng)的區(qū)別在于：1、工作任務(wù)不同；2、所屬機(jī)構(gòu)不同；3、管轄領(lǐng)域不同。

工作任務(wù)不同：中統(tǒng)的工作重心是監(jiān)控國民黨機(jī)關(guān)內(nèi)部情況；打擊一切國民黨之外的黨派；控制社會輿論和思想。軍統(tǒng)主要任務(wù)是收集各類情報、對軍隊監(jiān)視整治，對敵對勢力逮捕暗殺。

所屬機(jī)構(gòu)不同：中統(tǒng)的是黨中央的情報機(jī)構(gòu)。軍統(tǒng)的是直接屬于國民黨軍隊序列。

管轄領(lǐng)域不同：軍統(tǒng)主要管轄軍隊、警憲以及各地的交通部門。中統(tǒng)主要管轄的就是國民黨的黨務(wù)問題以及全國各地的行政機(jī)關(guān)以及學(xué)校的黨務(wù)問題，還有社會上的教化輿論。

中國國民黨中央執(zhí)行委員會調(diào)查統(tǒng)計局，簡稱中統(tǒng)。中統(tǒng)以各級國民黨黨部為基地，在各省市國民黨黨務(wù)內(nèi)，均設(shè)有調(diào)查統(tǒng)計室，在大學(xué)院校、重點中學(xué)、文化團(tuán)體內(nèi)，也都建立了所謂的黨員調(diào)查網(wǎng)，從事各種特務(wù)活動。中統(tǒng)的主要任務(wù)是調(diào)查和掌握，包括共產(chǎn)黨在內(nèi)的國民黨敵對勢力，從而穩(wěn)固國民黨的統(tǒng)治。

在抗戰(zhàn)之前，中統(tǒng)的勢力非常大。中統(tǒng)的實際控制人陳果夫，陳立夫兄弟，本身在國民黨內(nèi)具有強(qiáng)大的勢力。當(dāng)時有“蔣家天下陳家黨”之說，可見陳氏兄弟在國民黨內(nèi)的地位。因此，國民黨的各級基層黨組織，都是中統(tǒng)的特務(wù)網(wǎng)延伸。

但是抗戰(zhàn)期間，由于大片國土淪陷，淪陷區(qū)內(nèi)的國民黨基層機(jī)關(guān)基本上都被破壞，中統(tǒng)勢力大為縮水。再加上陳氏兄弟并不如戴笠一般對蔣介石唯命是從，中統(tǒng)所獲資源也漸漸不如軍統(tǒng)，因此，軍統(tǒng)勢力在成立后期逐漸大于中統(tǒng)。

軍統(tǒng)全稱為國民黨軍事委員會調(diào)查統(tǒng)計局。九一八事變后，蔣介石為了進(jìn)一步加強(qiáng)集權(quán)，黃埔生賀衷寒、戴笠、鄭介民、康澤等人組織了一個以軍人為主體的復(fù)興社（又稱藍(lán)衣社）。1932年，在復(fù)興社內(nèi)，又設(shè)了力行社，并設(shè)有一個專門進(jìn)行諜報活動的特務(wù)處，戴笠任處長，這就是軍統(tǒng)的前身。

軍統(tǒng)和中統(tǒng)從來沒有和睦相處過，兩大特務(wù)組織互相仇視，甚至出現(xiàn)過殺害對方特工人員的行為?？梢?，兩大特務(wù)組織的爭斗已進(jìn)入白熱化。當(dāng)然，1949隨著國民黨敗退臺灣，兩大特務(wù)組織紛紛改組，蔣經(jīng)國接手國民黨情報機(jī)構(gòu)，中統(tǒng)和軍統(tǒng)（保密局）也徹底煙消云散。